肝内胆管结石的治疗方法主要有以下三种
1）胆管切开取石术
单纯胆管切开取石引流术多用于急症和重症患者，暂时疏通胆道、控制胆道感染、改善肝功能以挽救生命。
2）肝部分切除术
切除病变肝段以最大限度地清除含有结石、狭窄及扩张胆管的病灶，是治疗肝内胆管结石最常用的方法。
3）肝门部胆管狭窄修复重建术
如胆管狭窄成形、空肠Roux-en-Y吻合术或胆管狭窄成形、组织补片修复术，使用与肝内病灶和上游肝管狭窄已去除的肝门部胆管狭窄病例。